正相色譜（NPC）是采用極性固定相（如帶有二醇基、氨基、和氰基的固定相及硅膠等），流動相通常使用比鍵合相極性小的非極性或弱極性有機溶劑，如烴類溶劑，或其中加入一定量的極性溶劑（如氯仿、醇、四氫呋喃、乙腈等），以調節流動相的洗脫強度。是一種根據目標物的極性差異將其分開的液相色譜技術。

一般認為正相色譜的分離機制屬于分配色譜。

● 在正相色譜中，樣品分子與載體基質的硅醇基團發生特異的極性相互作用，與固定相產生強極性相互作用的極性樣品分子比較難被洗脫，在柱內停留比較長的時間。

● 反之，極性較弱或非極性分子與硅膠之間產生相對較弱的相互作用，比較容易被洗脫，因而在柱內停留的時間較短。組分的分配比K值，隨其極性的增加而增大，但隨流動相中極性溶劑的極性增大（或濃度增大）而降低。

● 同時，固定相的極性越大，組分的保留值越大。

因此，正相色譜可以根據目標物的極性差別而達到分離目的。

在正相色譜分離中，可通過薄層色譜法（TLC）選擇合適的流動相。

正相色譜常用的四種固定相，極性大小順序是：

硅膠>氨基>二醇基>氰基

正相色譜的適用范圍：

1）適合用于分離異構體；

2）適用于絕不溶于水的化合物；

3）適用于分離在反相色譜中不保留或極性較強的化合物，比如生物堿、核苷酸類、有機酸等。

反相色譜（RPC）是指利用非極性的反相介質為固定相，極性有機溶劑、水溶液為流動相，根據溶質極性(疏水性)的差別進行溶質分離與純化的洗脫色譜法。

● 反相色譜的固定相大多是在硅膠表面鍵合疏水基團，基于樣品中的不同組分和疏水基團之間疏水作用的不同而分離。

● 在生物大分子分離中，多采用離子強度較低的酸性水溶液，添加一定量乙腈、異丙醇或甲醇等與水互溶的有機溶劑作為流動相。

● 樣品流出色譜柱的順序是極性較強的組分最先被沖洗出，而極性弱的組分會在色譜柱保留更強，后出峰。

反相色譜常用的固定相種類有：

C18、C8、C4、C3、C1、苯基、C30、PFP等。

反相色譜主要應用于相對分子質量低于5000，特別是1000以下的弱極性和非極性小分子物質的分析和純化，如蛋白質、肽、氨基酸、核酸、甾類、脂類、脂肪酸、糖類、植物堿等含有非極性基團的各種物質。